Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms