Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms