Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD1Q9BXT4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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