Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AKAP9Q99996 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms