Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX2Q99697 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PITX2Q99697 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms