Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3R4Q99570 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3R4Q99570 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms