Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms