Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAP1L3Q99457 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms