Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms