Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT8L2Q96SF2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT8L2Q96SF2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCT8L2Q96SF2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCT8L2Q96SF2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms