Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms