Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms