Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ULK4Q96C45 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ULK4Q96C45 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ULK4Q96C45 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms