Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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UBE2E3Q969T4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E3Q969T4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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UBE2E3Q969T4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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