Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPS3Q969F9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms