Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms