Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms