Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTC21AQ8NDW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms