Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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