Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf40Q8IXQ3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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