Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms