Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TCF23Q7RTU1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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