Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP34Q70CQ2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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