Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms