Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms