Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms