Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms