Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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