Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms