Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHOD3Q2V2M9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHOD3Q2V2M9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms