Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC27Q2M243 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms