Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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