Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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