Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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