Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TWIST1Q15672 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms