Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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