Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYCP1Q15431 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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