Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms