Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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