Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NWD1Q149M9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms