Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMC1AQ14683 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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