Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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