Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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CNGB1Q14028 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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