Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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