Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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