Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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