Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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