Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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