Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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