Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XRCC4Q13426 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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